Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2AFVQ71UI9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms