Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNI2Q6ZMN8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms