Protein–RNA interactions for Protein: Q6YHK3

CD109, CD109 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD109Q6YHK3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CD109Q6YHK3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CD109Q6YHK3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CD109Q6YHK3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CD109Q6YHK3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CD109Q6YHK3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CD109Q6YHK3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CD109Q6YHK3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
CD109Q6YHK3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CD109Q6YHK3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CD109Q6YHK3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CD109Q6YHK3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
CD109Q6YHK3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CD109Q6YHK3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CD109Q6YHK3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CD109Q6YHK3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CD109Q6YHK3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CD109Q6YHK3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CD109Q6YHK3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CD109Q6YHK3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CD109Q6YHK3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CD109Q6YHK3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CD109Q6YHK3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CD109Q6YHK3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CD109Q6YHK3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms