Protein–RNA interactions for Protein: Q6VN20

RANBP10, Ran-binding protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANBP10Q6VN20 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RANBP10Q6VN20 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms