Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms