Protein–RNA interactions for Protein: Q6V0L0

CYP26C1, Cytochrome P450 26C1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26C1Q6V0L0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP26C1Q6V0L0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP26C1Q6V0L0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP26C1Q6V0L0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP26C1Q6V0L0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP26C1Q6V0L0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP26C1Q6V0L0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP26C1Q6V0L0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP26C1Q6V0L0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP26C1Q6V0L0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP26C1Q6V0L0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP26C1Q6V0L0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP26C1Q6V0L0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP26C1Q6V0L0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP26C1Q6V0L0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP26C1Q6V0L0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP26C1Q6V0L0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP26C1Q6V0L0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP26C1Q6V0L0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP26C1Q6V0L0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP26C1Q6V0L0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP26C1Q6V0L0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP26C1Q6V0L0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP26C1Q6V0L0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP26C1Q6V0L0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP26C1Q6V0L0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP26C1Q6V0L0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP26C1Q6V0L0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP26C1Q6V0L0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP26C1Q6V0L0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP26C1Q6V0L0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP26C1Q6V0L0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP26C1Q6V0L0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP26C1Q6V0L0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms