Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms