Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms