Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms