Protein–RNA interactions for Protein: Q6UB28

METAP1D, Methionine aminopeptidase 1D, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
METAP1DQ6UB28 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
METAP1DQ6UB28 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
METAP1DQ6UB28 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
METAP1DQ6UB28 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
METAP1DQ6UB28 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
METAP1DQ6UB28 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
METAP1DQ6UB28 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
METAP1DQ6UB28 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
METAP1DQ6UB28 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
METAP1DQ6UB28 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
METAP1DQ6UB28 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
METAP1DQ6UB28 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
METAP1DQ6UB28 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
METAP1DQ6UB28 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms