Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC174Q6PII3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC174Q6PII3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC174Q6PII3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC174Q6PII3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC174Q6PII3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC174Q6PII3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC174Q6PII3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC174Q6PII3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC174Q6PII3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC174Q6PII3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC174Q6PII3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC174Q6PII3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms