Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms