Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms