Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms