Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ANKRD40Q6AI12 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms