Protein–RNA interactions for Protein: Q68D06

SLFN13, Schlafen family member 13, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN13Q68D06 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLFN13Q68D06 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms