Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TNS3Q68CZ2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TNS3Q68CZ2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TNS3Q68CZ2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TNS3Q68CZ2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TNS3Q68CZ2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TNS3Q68CZ2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
TNS3Q68CZ2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TNS3Q68CZ2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TNS3Q68CZ2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TNS3Q68CZ2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TNS3Q68CZ2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TNS3Q68CZ2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TNS3Q68CZ2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TNS3Q68CZ2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TNS3Q68CZ2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
TNS3Q68CZ2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TNS3Q68CZ2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TNS3Q68CZ2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TNS3Q68CZ2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TNS3Q68CZ2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TNS3Q68CZ2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TNS3Q68CZ2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TNS3Q68CZ2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TNS3Q68CZ2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TNS3Q68CZ2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms