Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAMD13Q5VXD3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms