Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms