Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms