Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT97

SYDE2, Rho GTPase-activating protein SYDE2, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE2Q5VT97 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYDE2Q5VT97 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms