Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D2

TREML2, Trem-like transcript 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML2Q5T2D2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TREML2Q5T2D2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TREML2Q5T2D2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TREML2Q5T2D2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TREML2Q5T2D2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TREML2Q5T2D2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TREML2Q5T2D2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TREML2Q5T2D2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TREML2Q5T2D2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TREML2Q5T2D2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TREML2Q5T2D2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TREML2Q5T2D2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TREML2Q5T2D2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TREML2Q5T2D2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TREML2Q5T2D2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TREML2Q5T2D2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TREML2Q5T2D2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TREML2Q5T2D2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TREML2Q5T2D2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TREML2Q5T2D2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TREML2Q5T2D2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TREML2Q5T2D2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TREML2Q5T2D2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TREML2Q5T2D2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TREML2Q5T2D2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TREML2Q5T2D2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TREML2Q5T2D2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TREML2Q5T2D2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TREML2Q5T2D2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TREML2Q5T2D2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TREML2Q5T2D2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TREML2Q5T2D2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TREML2Q5T2D2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TREML2Q5T2D2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TREML2Q5T2D2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TREML2Q5T2D2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TREML2Q5T2D2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TREML2Q5T2D2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TREML2Q5T2D2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TREML2Q5T2D2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TREML2Q5T2D2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TREML2Q5T2D2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TREML2Q5T2D2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TREML2Q5T2D2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms