Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZD1

C6orf141, Uncharacterized protein C6orf141, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf141Q5SZD1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C6orf141Q5SZD1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C6orf141Q5SZD1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C6orf141Q5SZD1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C6orf141Q5SZD1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C6orf141Q5SZD1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C6orf141Q5SZD1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C6orf141Q5SZD1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C6orf141Q5SZD1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C6orf141Q5SZD1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C6orf141Q5SZD1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C6orf141Q5SZD1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C6orf141Q5SZD1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C6orf141Q5SZD1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C6orf141Q5SZD1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
C6orf141Q5SZD1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
C6orf141Q5SZD1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms