Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXM1

ZNF678, Zinc finger protein 678, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF678Q5SXM1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF678Q5SXM1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF678Q5SXM1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF678Q5SXM1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF678Q5SXM1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF678Q5SXM1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF678Q5SXM1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF678Q5SXM1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF678Q5SXM1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF678Q5SXM1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF678Q5SXM1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF678Q5SXM1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF678Q5SXM1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF678Q5SXM1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF678Q5SXM1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.9 ms