Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCID2Q5JVF3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms