Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms