Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf116Q5BN46 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf116Q5BN46 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf116Q5BN46 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf116Q5BN46 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf116Q5BN46 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf116Q5BN46 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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C9orf116Q5BN46 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf116Q5BN46 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf116Q5BN46 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf116Q5BN46 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf116Q5BN46 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf116Q5BN46 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf116Q5BN46 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf116Q5BN46 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf116Q5BN46 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf116Q5BN46 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf116Q5BN46 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf116Q5BN46 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf116Q5BN46 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf116Q5BN46 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf116Q5BN46 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf116Q5BN46 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf116Q5BN46 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf116Q5BN46 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf116Q5BN46 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf116Q5BN46 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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C9orf116Q5BN46 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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C9orf116Q5BN46 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf116Q5BN46 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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C9orf116Q5BN46 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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C9orf116Q5BN46 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf116Q5BN46 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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C9orf116Q5BN46 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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C9orf116Q5BN46 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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C9orf116Q5BN46 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf116Q5BN46 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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C9orf116Q5BN46 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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C9orf116Q5BN46 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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