Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms