Protein–RNA interactions for Protein: Q562R1

ACTBL2, Beta-actin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBL2Q562R1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTBL2Q562R1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTBL2Q562R1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTBL2Q562R1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTBL2Q562R1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTBL2Q562R1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTBL2Q562R1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTBL2Q562R1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTBL2Q562R1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTBL2Q562R1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTBL2Q562R1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTBL2Q562R1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTBL2Q562R1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTBL2Q562R1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTBL2Q562R1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTBL2Q562R1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTBL2Q562R1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTBL2Q562R1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTBL2Q562R1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTBL2Q562R1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTBL2Q562R1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTBL2Q562R1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTBL2Q562R1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTBL2Q562R1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTBL2Q562R1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTBL2Q562R1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTBL2Q562R1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTBL2Q562R1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTBL2Q562R1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTBL2Q562R1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTBL2Q562R1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTBL2Q562R1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTBL2Q562R1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTBL2Q562R1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTBL2Q562R1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTBL2Q562R1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTBL2Q562R1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTBL2Q562R1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTBL2Q562R1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTBL2Q562R1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTBL2Q562R1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms