Protein–RNA interactions for Protein: Q53GD3

SLC44A4, Choline transporter-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A4Q53GD3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms