Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC39A12Q504Y0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms