Protein–RNA interactions for Protein: Q499Z3

SLFNL1, Schlafen-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFNL1Q499Z3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLFNL1Q499Z3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SLFNL1Q499Z3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLFNL1Q499Z3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFNL1Q499Z3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFNL1Q499Z3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFNL1Q499Z3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFNL1Q499Z3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFNL1Q499Z3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFNL1Q499Z3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFNL1Q499Z3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFNL1Q499Z3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFNL1Q499Z3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFNL1Q499Z3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFNL1Q499Z3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFNL1Q499Z3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFNL1Q499Z3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLFNL1Q499Z3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLFNL1Q499Z3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLFNL1Q499Z3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms