Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXY7

LRIT3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT3Q3SXY7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRIT3Q3SXY7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms