Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIR4

TMEM30B, Cell cycle control protein 50B, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30BQ3MIR4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM30BQ3MIR4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms