Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TWISTNBQ3B726 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TWISTNBQ3B726 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TWISTNBQ3B726 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TWISTNBQ3B726 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TWISTNBQ3B726 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TWISTNBQ3B726 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TWISTNBQ3B726 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TWISTNBQ3B726 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TWISTNBQ3B726 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TWISTNBQ3B726 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TWISTNBQ3B726 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TWISTNBQ3B726 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TWISTNBQ3B726 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TWISTNBQ3B726 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TWISTNBQ3B726 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TWISTNBQ3B726 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TWISTNBQ3B726 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TWISTNBQ3B726 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TWISTNBQ3B726 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TWISTNBQ3B726 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TWISTNBQ3B726 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TWISTNBQ3B726 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TWISTNBQ3B726 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TWISTNBQ3B726 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TWISTNBQ3B726 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms