Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
UVSSAQ2YD98 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms