Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTC1Q2NKJ3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTC1Q2NKJ3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CTC1Q2NKJ3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CTC1Q2NKJ3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTC1Q2NKJ3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTC1Q2NKJ3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTC1Q2NKJ3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTC1Q2NKJ3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CTC1Q2NKJ3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTC1Q2NKJ3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTC1Q2NKJ3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTC1Q2NKJ3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTC1Q2NKJ3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTC1Q2NKJ3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTC1Q2NKJ3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTC1Q2NKJ3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTC1Q2NKJ3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTC1Q2NKJ3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTC1Q2NKJ3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTC1Q2NKJ3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTC1Q2NKJ3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTC1Q2NKJ3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CTC1Q2NKJ3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTC1Q2NKJ3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTC1Q2NKJ3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTC1Q2NKJ3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTC1Q2NKJ3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTC1Q2NKJ3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTC1Q2NKJ3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms