Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3M2

SLC5A9, Sodium/glucose cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A9Q2M3M2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms