Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3M2

SLC5A9, Sodium/glucose cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A9Q2M3M2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms