Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
FOXD1Q16676 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
FOXD1Q16676 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
FOXD1Q16676 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
FOXD1Q16676 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
FOXD1Q16676 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
FOXD1Q16676 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
FOXD1Q16676 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
FOXD1Q16676 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
FOXD1Q16676 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
FOXD1Q16676 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
FOXD1Q16676 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
FOXD1Q16676 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
FOXD1Q16676 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
FOXD1Q16676 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
FOXD1Q16676 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
FOXD1Q16676 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
FOXD1Q16676 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
FOXD1Q16676 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
FOXD1Q16676 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC32.55■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC32.52■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
FOXD1Q16676 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC32.51■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
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