Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
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STX1AQ16623 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STX1AQ16623 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
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