Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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CTF1Q16619 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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CTF1Q16619 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
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