Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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