Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGCAQ16586 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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