Protein–RNA interactions for Protein: Q16558

KCNMB1, Calcium-activated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB1Q16558 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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KCNMB1Q16558 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
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KCNMB1Q16558 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
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KCNMB1Q16558 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
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KCNMB1Q16558 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNMB1Q16558 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNMB1Q16558 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNMB1Q16558 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNMB1Q16558 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNMB1Q16558 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNMB1Q16558 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNMB1Q16558 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNMB1Q16558 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNMB1Q16558 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNMB1Q16558 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNMB1Q16558 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNMB1Q16558 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNMB1Q16558 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNMB1Q16558 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNMB1Q16558 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNMB1Q16558 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNMB1Q16558 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNMB1Q16558 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNMB1Q16558 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNMB1Q16558 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNMB1Q16558 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNMB1Q16558 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNMB1Q16558 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNMB1Q16558 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNMB1Q16558 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNMB1Q16558 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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