Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKN1Q16512 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms