Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMA4Q16363 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
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