Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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