Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALX1Q15699 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
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