Protein–RNA interactions for Protein: Q15599

SLC9A3R2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3R2Q15599 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC9A3R2Q15599 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC9A3R2Q15599 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC9A3R2Q15599 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC9A3R2Q15599 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC9A3R2Q15599 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC9A3R2Q15599 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC9A3R2Q15599 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC9A3R2Q15599 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC9A3R2Q15599 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC9A3R2Q15599 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC9A3R2Q15599 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC9A3R2Q15599 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC9A3R2Q15599 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC9A3R2Q15599 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC9A3R2Q15599 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC9A3R2Q15599 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC9A3R2Q15599 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC9A3R2Q15599 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC9A3R2Q15599 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC9A3R2Q15599 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC9A3R2Q15599 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC9A3R2Q15599 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC9A3R2Q15599 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC9A3R2Q15599 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC9A3R2Q15599 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC9A3R2Q15599 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC9A3R2Q15599 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC9A3R2Q15599 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC9A3R2Q15599 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC9A3R2Q15599 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC9A3R2Q15599 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC9A3R2Q15599 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC9A3R2Q15599 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC9A3R2Q15599 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC9A3R2Q15599 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC9A3R2Q15599 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC9A3R2Q15599 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC9A3R2Q15599 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
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