Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SIX1Q15475 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
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